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PubMed : Trucs et astuces: Rechercher via le Portail terminologique de santé

Guides pour maîtriser PubMed, moteur de recherche de données bibliographiques de l'ensemble des domaines de spécialisation de la biologie et de la médecine.

Portail terminologique de santé : qu'est-ce que c'est ?

Le portail terminologique de santé (ou HeTOP en anglais, pour Health Terminology / Ontology Portal) fait partie du Cismef, Catalogue et index des sites médicaux de langue française, géré par le CHU de Rouen. Il permet d’interroger la traduction française du MeSH et de lancer directement une requête dans PubMed à partir des mots-clés en français. Il permet de créer une équation de recherche complexe prenant en compte les articles qui ne sont pas encore indexés en MeSH.

MeSH en français

Vidéo DocToBib : CISMEF

Utilisation du portail terminologique de santé

Pour trouver un terme MeSH à partir d'un mot français, sélectionner la terminologie MeSH et lancer la recherche. Attention à bien vérifier dans la liste des résultats à gauche que c'est le bon terme qui est sélectionné.

La définition, la traduction et les synonymes du terme recherché apparaissent dans le panneau à droite. Cette étape suffit lorsqu'on ne cherche que la traduction en anglais d'un mot : voir sous "libellé préféré".

Dans l'onglet Description, on retrouve la traduction, la définition et les synonyme du mot-clé.

Dans l'onglet hiérarchie, on retrouve l'arborescence MeSH, traduite en français.

A savoir : il peut y avoir quelques différences entre la version française et la version anglaise, la version française n'étant pas mise à jour en temps réel.


 

Dans l'onglet Relations se trouve une sélection de liens vers des ressources complémentaires, notamment la liste des qualificatifs en français :

Quelques qualificatifs :

L'onglet PubMed/Doc Cismef permet d'interroger PubMed directement, après avoir sélectionné les qualificatifs souhaités (classés par thème) et choisi le cas échéant "seulement les principales" (équivalent de Major Topic), puis en cliquant sur l'icône PubMed. L'avantage de cette interface est que l'équation créée prendra en compte les articles qui ne sont pas indexés en MeSH, en récupérant automatiquement tous les synonymes.

Exemple d'une requête lancée à partir du PTS, prenant en compte tous les synonymes :

Sur la page de résultats, le message d'erreur suivant peut apparaître :

Cela signifie simplement que certains synonymes récupérés automatiquement par le PTS ne sont pas présents en tant qu'expression exacte dans PubMed, par exemple "dementias, senile".

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