Les bibliothèques de médecine sont réparties sur plusieurs sites.
Sur le site de la Pitié-Salpêtrière :
- -la bibliothèque de la Pitié, la bibliothèque Charcot (centrée sur des collections patrimoniales) et la bibliothèque Dechaume
Sur le site de Saint-Antoine :
- -la bibliothèque hospitalière Axial-Caroli et la bibliothèque universitaire Saint-Antoine
Sur les sites Tenon et Trousseau:
- -les bibliothèques sont situées au coeur des hôpitaux éponymes.